Anche se la fibromialgia non è classificata come una malattia autoimmune, condivide i sintomi con le malattie autoimmuni, come l'artrite reumatoide, l'ipotiroidismo e il lupus. Coloro che hanno un disturbo da stress post-traumatico, o PTSD, hanno una maggiore incidenza di fibromialgia, così come coloro che sono obesi. La fibromialgia si verifica spesso con:
- Artrite
- La malattia celiaca
- Sinusite cronica
- Sindrome da fatica cronica
- Depressione
- Disturbo d'ansia generale, o GAD
- Cistite interstiziale, o IC
- Sindrome dell'intestino irritabile
- Emicranie
- Sindrome del dolore miofasciale
- Disturbo dell'articolazione temporomandibolare, o TMJ
I sintomi della fibromialgia sono spesso mal diagnosticati perché imitano i sintomi di altri disturbi e hanno gli stessi fattori scatenanti.